ঢাকা থেকে মাত্র ৬৮ কিলো দূরে এবং টাংগাইল সদর থেকে ২৮ কিলো পুর্ব দিকে এ উপজেলাটি অবস্থিত। মির্জাপুর উপজেলার উত্তরে সখিপুর, দক্ষিনে ধামরাই, পুর্বে কালিয়াকৈর এবং পশ্চিমে দেলদুয়ার উপজেলার অবস্থান। মির্জাপুরকে বলা হয় উত্তরবংগের দরজা। ঢাকা থেকে টাংগাইল এর যে কোন উপজেলায় যাবার একমাত্র রাস্তাটি মির্জাপুরের উপর দিয়ে চলে গেছে। মির্জাপুরের উত্তর পাশ দিয়ে বয়ে গেছে বংশাই নদী এবং দক্ষিণ পাশ দিয়ে বয়ে গেছে লৌহজং নদী।